Το Δευτερεύον Πρόγραμμα στη Βιοϊατρική Μηχανική (ΒΜ) είναι ανοικτό σε όλους τους φοιτητές του Πανεπιστημίου. Αποτελείται από 10 μαθήματα με συνολικό φόρτο εργασίας τουλάχιστον 60 τπιστωτικών μονάδων. Λόγω ανομοιομορφίας στον αριθμό των πιστωτικών μονάδωνμεταξύ συμμετεχόντων τμημάτων σε ειδικές περιπτώσεις θα γίνεται εξαίρεση για 10 μαθήματα του προγράμματος που συγκεντρώνουν 57 και άνω πιστωτικών μονάδων.. Οι φοιτητές οφείλουν να συμπληρώσουν το δευτερεύον πτυχίο μέσα στα 8-12 εξάμηνα τα οποία παρέχονται για τη συμπλήρωση ενός κανονικού πτυχίου. Η επιλογή των μαθημάτων μπορεί να γίνει μεταξύ των προσφερόμενων μαθημάτων σε Χειμερινό και Εαρινό εξάμηνο:
Χειμερινό Εξάμηνο
BIO 101 Εισαγωγή στη Σύγχρονη Βιολογία
ΒΙΟ 354 Βιολογία Συστημάτων
ΒΙΟ 431 Ειδικά Θέματα Υπολογιστικής και Συστημικής Βιολογίας
ΒΙΟ 432 Κλινική Βιοπληροφορική
ΒΙΟ 442, 443 Πρακτική Άσκηση στη Βιολογία
ΒΙΟ 495, 496, 497, 498, 499 Σύγχρονα Θέματα Βιολογίας
ΕΠΛ 435 Αλληλεπίδραση Ανθρώπου-Υπολογιστή
ΕΠΛ 445 Ψηφιακή Επεξεργασία Εικόνας
ΗΜΥ 421 Ευφυή Συστήματα
ΗΜΥ 425 Ρομποτική
ΗΜΥ 429 Εισαγωγή στην Επεξεργασία Ψηφιακών Σημάτων
ΗΜΥ 434 Εισαγωγή στην Φωτονική
HMY 471 Νευροφυσιολογία και Αισθήσεις
ΗΜΥ 476 Βιοϊατρική Απεικόνιση
ΗΜΥ 480 Πράκτορες Λογισμικού
MMΚ 432 Εισαγωγή σε Διαγνωστικές και Απεικονιστικές Τεχνικές
MMΚ 433 Εμβιομηχανική και Ανθρώπινη Κίνηση
MMK 477 Υπολογιστική Ρευστομηχανική στη Βιοϊατρική
ΜΜΚ 533 Εφαρμογές Μηχανικής Ακουστικής στη Βιομηχανία και Βιοϊατρική
MMΚ 534 Θέματα Βιοιατρικών Υπερήχων
MMΚ 536 Εισαγωγή στη Μαγνητική Τομογραφία
MMΚ 542 Εισαγωγή στη Ρομποτική
ΒΜΤ ΧΧΧ Επιβλεπόμενη Μελέτη Βιοϊατρικής Μηχανικής
ΒΜΤ ΧΧΧ Εξειδικευμένα Θέματα Μηχανικής Βιοϊατρικής Τεχνολογίας
Εαρινό Εξάμηνο
BIO 331 Υπολογιστική και Συστηµική Βιολογία
ΒΙΟ 442, 443 Πρακτική Άσκηση στη Βιολογία
ΒΙΟ 495, 496, 497, 498, 499 Σύγχρονα Θέματα Βιολογίας
ΕΠΛ 341 Τεχνητή Νοημοσύνη
ΕΠΛ 444 Συστήματα Υπολογιστικής Νοημοσύνης
ΗΜΥ 428 Εργαστήριο Συστημάτων Ελέγχου
ΗΜΥ 435 Εργαστήριο Οπτικής και Φωτονικής (δεν προσφέρετε επί του παρόντος)
ΗΜΥ 450 Θεωρία Πληροφορίας
ΗΜΥ 473 Βιοϊατρική Οργανολογία και Σχεδιασμός
ΗΜΥ 474 Εργαστήριο Βιοϊατρικής Οργανολογίας και Σχεδιασμού
ΗΜΥ 477 Βιοϊατρική Οπτική
ΗΜΥ 478 Επεξεργασία Εικόνας
MMΚ 332 Φυσιολογία και Εμβιομηχανική
MMΚ 431 Θεραπευτικές και Διαγνωστικές εφαρμογές Υπερήχων
ΜΜΚ 434 Μηχανική κυττάρων και ιστών
MMΚ 535 Ιατρική Διαγνωστική Απεικόνιση με Υπέρηχους
ΜΜΚ 531 Μηχανική Συνεχών Μέσων
MMΚ 542 Εισαγωγή στην Ρομποτική
MMΚ 555 Ιδιότητες Πολυμερών και Πολυμερή σε Ιατρικές Εφαρμογές
ΒΜ ΧΧΧ Επιβλεπόμενη Μελέτη Βιοϊατρικής Μηχανικής
ΒΜ ΧΧΧ Εξειδικευμένα Θέματα Μηχανικής Βιοϊατρικής Τεχνολογίας
Οι φοιτητές μπορούν να εγγραφούν σε μέχρι και 2 από τα παρακάτω μεταπτυχιακά μαθήματα:
Χειμερινό Εξάμηνο
BIO 670 Οπτική Απεικόνιση στη Βιολογία
ΕΠΛ 604 Τεχνητή Νοημοσύνη
ΕΠΛ 607 Γραφικός και Εικονικός Υπολογισμός
ΕΠΛ 679 Ηλεκτρονική Υγεία
ΗΜΥ 627 Μηχανική Όραση (παρόμοιο με ΕΠΛ 668)
Εαρινό Εξάμηνο
BIO 630 Νουκλεϊνικά Οξέα
BIO 650 Ειδικά Θέματα Βιοπληροφορικής
ΕΠΛ 667 Νευρο-υπολογιστική Επιστήμη
ΕΠΛ 668 Υπολογιστική Όραση (παρόμοιο με ΗΜΥ 627)
Για απόκτηση δευτερεύοντος πτυχίου οι φοιτητές πρέπει να συμπληρώσουν τουλάχιστον 5 επιπρόσθετα μαθήματα που δεν έχουν προσμετρηθεί στην απόκτηση του κυρίως πτυχίου τους. Ένα από τα επιλεγόμενα μαθήματα του Δευτερεύοντος Πρόγραμματος στη Βιοϊατρική Μηχανική μπορεί να είναι ένα από τα μάθηματα «Επιβλεπόμενη Μελέτη Βιοϊατρικής Μηχανικής» ή «Εξειδικευμένα Θέματα Μηχανικής Βιοϊατρικής Τεχνολογίας».